荔枝根系由主根、侧根、须根及根毛组成。主根和侧根主要起固定植株的作用。须根及根毛起吸收土壤水分和养分的作用。荔枝根系分布的深浅因繁殖方法、土壤性质、地下水位、树龄及栽培管理不同而异。实生繁殖苗和嫁接繁殖苗具有长而发达的主根，根群深广；高压繁殖苗无主根，根系分布较浅；山脚冲积土层厚，根系较深；平地土层较薄，根浅生的；地下水位高，分布也较浅。荔枝根群主要集中分布在0.1-1.5m深的土层中，荔枝根系的水平分布可比树冠大1-2倍。
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荔枝花演黄绿色，型小，无花瓣，具4-5枚小粤片；花合生，杯状，在花弯上面有花盘突起；雕雄蕊着生在花盘上，花盘上的蜜腺能分泌蜜汁，利于昆虫传粉。荔枝花性杂，有雄花、雌花、花、花四种类型。雌雄同株同穗异花，一个花序中雌雄花混生，数整穗全都是雄花或雄花。雌花、花少。雌花的比例因不同年份、品种、植株、结果母枝、花序着生位置的不同而不同。
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雌花：雄蕊退化，花丝短而宿存于基部，花药通常不开裂。雌蕊发育完全，子房通常两室，开花时柱头分叉，授粉受精后子房发育成果实。多数只有1室发育成单果，仅少数两室一起发育成双果。雄花：雌蕊退化，仅残留一突起点或一个只有花柱但无柱头的子房。雄蕊发育完全，成熟时花药纵裂，散出黄色花粉。花：雄蕊正常能散出花粉，子房也发育正常，天津果蔬粉，柱头能开裂授粉，是能结果的完全花。花：子房多室，花丝多数，是不能结果的完全花。
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